Artikkelit

ELIXIR: Euroopan laajuinen infrastruktuuri biotieteiden datalle

ELIXIR on eurooppalainen biotieteiden datan infrastruktuuri, joka on Euroopan laajuisesti koonnut yhteen kansalliset osakeskukset ja bio- ja terveystieteiden resurssit. ELIXIR Suomi toimii yhtenä kansallisena osakeskuksena. ELIXIR Suomen toiminnasta vastaa CSC.

Kasvava Avointen oppimateriaalien kirjasto

Erilaiset digitaaliset opetusvälineet ja -materiaalit ovat olleet opetuksen ja oppimisen arkea jo pitkään. Viimeistään vuoden 2020 maaliskuu osoitti, miten tärkeässä osassa esimerkiksi digitaaliset oppimateriaalit opetuksessa ovat.

Kultananoklusterit syöpälääkkeeen kantajina

Kultananoklusterit voivat kuljettaa lääkeaineita tarkasti syöpäsoluihin vahingoittamatta terveitä kudoksia. Jyväskylän yliopiston Nanotiedekeskuksen tutkijat osoittivat atomististen molekyylidynamiikkasimulointien avulla, että syöpää tunnistavien ja lääkeainemolekyylien suhde on kriittinen parametri kultaklusterien ominaisuuksien optimoinnissa, jotta klusterien tarttumistodennäköisyys syöpäsolujen pintaan voidaan maksimoida.

Suurteholaskenta ennen, nyt ja tulevaisuudessa - CSC:n HPC-asiantuntija Jussi Enkovaaran haastattelu

Saimme tilaisuuden haastatella Jussi Enkovaaraa, yhtä PRACE Autumn School: Harnessing EuroHPC Flagship Supercomputers -kurssin opettajista. Tällä hetkellä hän työskentelee HPC-asiantuntijana CSC:llä ja on ollut mukana superkoneiden ohjelmistojen kehittämisessä ja tuessa vuodesta 2005 lähtien.

Laskentateho ja -tuki suomalaisten yritysten apuna maailman valloituksessa

Speechly on suomalainen puhekäyttöliittymiin erikoistunut yritys, joka on kehittänyt uudenlaisen reaaliaikaisen puhutun kielen ymmärtämisen teknologian. CSC:n Puhti-supertietokoneen ja Business Finlandin AI Business -ohjelman avulla Speechly pääsi kehittämään puheentunnistusteknologiaansa entistä tarkemmaksi.

Paperitehtaasta yhdeksi maailman ympäristöystävällisimmistä datakeskuksista

CSC:n datakeskus Kajaanin Renforsin rannan yritysalueella on valmis vastaanottamaan LUMI-supertietokoneen. LUMIa varten rakennettu datakeskus on käynyt läpi perusteellisen muodonmuutoksen entisestä paperitehtaasta yhdeksi maailman ympäristöystävällisimmistä datakeskuksista.

Puhdilla koronaa vastaan: katsaus COVID-19 pikakaistan tuloksiin

COVID-19-pikakaistalle valittiin yhteensä 15 tutkimushanketta. Näissä hankkeissa on tutkittu viruksen leviämistä ilmateitse, etsitty tapoja estää viruksen kopioituminen, haettu mahdollisia lääkeaineita virtuaaliseulonnalla, tutkittu virusmutaatiota ja tunnistettu virusvariantteja sekvensoinnin avulla. Käytännössä lähes kaikki suomalaisista potilaista määritetyt tuhannet koronavirukset on luokiteltu Puhti-supertietokoneessa.

Suomen kansallinen EOSC-foorumi aloitti toimintansa

OKM, Suomen Akatemia, TSV ja CSC lanseerasivat 25. tammikuuta 2021 kansallisen EOSC-foorumin, joka on tarkoitettu EOSC:n eli eurooppalaisen tiedepilven (European Open Science Cloud) suomalaisille sidosryhmille. Suomen EOSC-foorumin englanninkielinen nimi on the EOSC Finnish Forum (EOSC-FF).

Fairdata PAS mahdollistaa tutkimusaineistojen pitkäaikaisen säilymisen

Fairdata PAS on tutkimusaineistojen pitkäaikaissäilytyspalvelu, jonka hyödyntäminen on mahdollista kaikille OKM:n alaisille toimijoille. Pitkäaikaissäilytyksellä tarkoitetaan digitaalisen informaation käytettävyyden ja ymmärrettävyyden ylläpitämistä yli vuosikymmenten.

Topologinen suprajohde – uusi vaihtoehto kubittien rakennusaineeksi

Laskennallisen ja kokeellisen tutkimuksen yhteistyöllä fyysikot ovat onnistuneet luomaan uudenlaisen materiaalin, topologisen suprajohteen, jota voidaan tulevaisuudessa käyttää kubittien rakennusaineena.

Yhteenveto Allas-palvelun käyttökatkosta

Osana avoimuuden periaatettamme julkaisemme yhteenvedon datanhallintajärjestelmä Altaan käyttökatkosta, toimintojen palautuksesta sekä kehittämisestä tulevien ongelmien ennaltaehkäisemiseksi.

EISCAT 3D -tutkajärjestelmä mullistaa ilmakehätutkimuksen

Pian valmistumassa olevan uuden EISCAT 3D -tutkajärjestelmän avulla saadaan revontulista kolmiulotteista kuvaa. Hanketta koordinoi Oulun yliopiston Sodankylän geofysiikan observatorio. CSC on hankkeessa tiiviisti mukana.

Käyttäjäkokemus: erinomainen!

CSC:n uusin supertietokone Mahti vihittiin tutkijoiden käyttöön virtuaalisena järjestetyssä seminaarissa 7.10. Tapahtumassa kuusi Mahdin pilottikäyttäjää jakoi ensikokemuksiaan Mahdin käytöstä.

Rakennebiologia, biokemia ja mitokondriaalisen kompleksi I:n MD-simulaatiot – apuproteiinilla on avainasema biokonversiossa

Rakennebiologian, biokemian ja monitasoisten molekyylidynamiikkasimulaatioiden yhdistäminen johti tutkijat Saksasta ja Suomesta havaitsemaan, että apualayksiköllä on keskeinen tehtävä bioenergetiikan keskeisen entsyymin, hengitysketjun kompleksi I:n, energiantuotannossa.

Jakaminen mahdollistaa 16 miljoonan rakenteen seulonnan 7 minuutissa

Tietokoneavusteinen tutkimus on olennainen osa lääkekehitystä. Schrödinger on kehittänyt uuden algoritmin, jossa voidaan hyödyntää GPU-suoritinta vastaavanlaisen geometriahaun suorittamiseksi, mikä nopeuttaa prosessia merkittävästi. Esikäsitellyn molekyylikirjastotiedoston jakaminen Puhdin levyltä vähentää seulontaan kuluvaa seinäkelloaikaa viikoista minuutteihin.

High-Performance Digitisation - giving a boost to the description of digital data

In the High-Performance Digitisation project, CSC, the National Archives and the National Library of Finland are jointly tackling the challenge of artificial intelligence and data processing. The purpose of the project is to create a service for memory organizations facilitating the processing of data: absence or inadequacy of metadata and poor search functions make digital material more difficult to use.

Rajapyykki saavutettu - uusi säteilyilmaisin on riittävän nopea kvanttitietokoneisiin

Aalto-yliopiston ja VTT:n tutkijat ovat kehittäneet uuden nanokokoisen säteilyilmaisimen, jolla voidaan mitata fotonien energiaa ja samalla määrittää kvanttitietokoneissa tarvittavien kubittien energiatila huomattavasti aiempaa tarkemmin ja nopeammin.

DeepFin luonnollisen kielen käsittelyn aallonharjalla

BERT-menetelmän eri kielille soveltamisen haasteena on ollut mallin kouluttamiseksi tarvittavan tekstisyötteen suuri määrä ja tämän vaatima laskentateho. Menetelmää suomen kieleen soveltava FinBERT-malli tuotettiin DeepFin-projektissa, joka oli yksi CSC:n Grand Challenge 2019 -pilottihankkeista.

Rakennebiologia apuna SARS-Cov2 lääkekehityksessä

Helsingin yliopiston Ville Paavilainen tutkii pienmolekyylejä, jotka saattavat estää SARS-CoV2-viruksen kopioitumisen ja sitä kautta sairastumisen COVID-19-tautiin. Nyt tiedetään, että nämä molekyylit estävät viruksen leviämistä soluviljelymalleissa ja laajempi testaus on alkamassa.

Visualisointi kertoo enemmän kuin tuhat lukusanaa

Laskenta ja mittaukset tuottavat numeroita. Ihminen on kehittynyt tulkitsemaan asioita, joita hän aisteillaan ympäristössään havaitsee, ei numerosarjoja. Aivot ovat tarkimmillaan kuvia analysoidessaan, joten on luonnollista visualisoida tutkimustulokset kuviksi.